MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium sp. 4-46 plasmid pM44602

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010374	GGA	2	6	158	163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825393
2	NC_010374	CGC	2	6	209	214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825393
3	NC_010374	GC	3	6	239	244	0 %	0 %	50 %	50 %	169825393
4	NC_010374	AAT	2	6	330	335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825393
5	NC_010374	CGA	2	6	362	367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
6	NC_010374	G	6	6	368	373	0 %	0 %	100 %	0 %	169825393
7	NC_010374	GCG	2	6	419	424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825393
8	NC_010374	TGCCG	2	10	486	495	0 %	20 %	40 %	40 %	169825393
9	NC_010374	CGA	2	6	535	540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
10	NC_010374	TCGC	2	8	560	567	0 %	25 %	25 %	50 %	169825393
11	NC_010374	GGA	2	6	581	586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825393
12	NC_010374	CTG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825393
13	NC_010374	AGC	2	6	651	656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
14	NC_010374	AGC	2	6	673	678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
15	NC_010374	CTG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825393
16	NC_010374	AGC	2	6	954	959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825394
17	NC_010374	CGT	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
18	NC_010374	CAT	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825394
19	NC_010374	CGAC	2	8	1090	1097	25 %	0 %	25 %	50 %	169825394
20	NC_010374	TGG	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825394
21	NC_010374	TTA	2	6	1213	1218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825394
22	NC_010374	GGCG	2	8	1227	1234	0 %	0 %	75 %	25 %	169825394
23	NC_010374	GCC	2	6	1254	1259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825394
24	NC_010374	ACCT	2	8	1275	1282	25 %	25 %	0 %	50 %	169825394
25	NC_010374	TCG	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
26	NC_010374	TCA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825394
27	NC_010374	GC	3	6	1404	1409	0 %	0 %	50 %	50 %	169825394
28	NC_010374	GGC	2	6	1427	1432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825394
29	NC_010374	GTTC	2	8	1463	1470	0 %	50 %	25 %	25 %	169825394
30	NC_010374	GCT	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
31	NC_010374	CGC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825394
32	NC_010374	CTGAG	2	10	1531	1540	20 %	20 %	40 %	20 %	169825394
33	NC_010374	GAG	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825394
34	NC_010374	TTCA	2	8	1701	1708	25 %	50 %	0 %	25 %	169825395
35	NC_010374	GAG	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825395
36	NC_010374	GCA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825395
37	NC_010374	CGATGG	2	12	2095	2106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169825396
38	NC_010374	CG	3	6	2165	2170	0 %	0 %	50 %	50 %	169825396
39	NC_010374	GCG	2	6	2182	2187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825396
40	NC_010374	TCGC	2	8	2200	2207	0 %	25 %	25 %	50 %	169825396
41	NC_010374	CCG	2	6	2224	2229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825396
42	NC_010374	CGC	2	6	2238	2243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825396
43	NC_010374	GTCA	2	8	2308	2315	25 %	25 %	25 %	25 %	169825397
44	NC_010374	GCC	2	6	2369	2374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825397
45	NC_010374	GCG	2	6	2576	2581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825398
46	NC_010374	GAGC	2	8	2654	2661	25 %	0 %	50 %	25 %	169825398
47	NC_010374	GGC	2	6	2775	2780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825398
48	NC_010374	AGGCC	2	10	2807	2816	20 %	0 %	40 %	40 %	169825398
49	NC_010374	CTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825398
50	NC_010374	CGGC	2	8	2844	2851	0 %	0 %	50 %	50 %	169825398
51	NC_010374	CTC	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825398
52	NC_010374	CGT	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825398
53	NC_010374	CGAT	2	8	2998	3005	25 %	25 %	25 %	25 %	169825398
54	NC_010374	CGG	2	6	3579	3584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825399
55	NC_010374	GCGA	2	8	3592	3599	25 %	0 %	50 %	25 %	169825399
56	NC_010374	GC	3	6	3638	3643	0 %	0 %	50 %	50 %	169825399
57	NC_010374	GAG	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825399
58	NC_010374	GCT	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825399
59	NC_010374	TCG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825399
60	NC_010374	GGT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825400
61	NC_010374	TGC	3	9	4228	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825400
62	NC_010374	GC	4	8	4254	4261	0 %	0 %	50 %	50 %	169825400
63	NC_010374	AG	3	6	4278	4283	50 %	0 %	50 %	0 %	169825400
64	NC_010374	CG	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	169825400
65	NC_010374	CGCT	2	8	4363	4370	0 %	25 %	25 %	50 %	169825400
66	NC_010374	GCG	2	6	4376	4381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
67	NC_010374	CGGC	2	8	4393	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	169825400
68	NC_010374	CGG	2	6	4427	4432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
69	NC_010374	GCG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
70	NC_010374	AC	3	6	4558	4563	50 %	0 %	0 %	50 %	169825401
71	NC_010374	AAG	2	6	4589	4594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
72	NC_010374	AT	3	6	4600	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	169825401
73	NC_010374	A	7	7	4615	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	169825401
74	NC_010374	TAGATA	2	12	4715	4726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169825401
75	NC_010374	TAT	2	6	4800	4805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825401
76	NC_010374	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
77	NC_010374	TG	3	6	4860	4865	0 %	50 %	50 %	0 %	169825401
78	NC_010374	AT	3	6	4875	4880	50 %	50 %	0 %	0 %	169825401
79	NC_010374	ACG	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825401
80	NC_010374	GGC	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825401
81	NC_010374	TTG	2	6	4973	4978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825401
82	NC_010374	AGT	2	6	4987	4992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825401
83	NC_010374	AAG	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
84	NC_010374	AGA	2	6	5110	5115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
85	NC_010374	TG	3	6	5153	5158	0 %	50 %	50 %	0 %	169825401
86	NC_010374	TGG	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825401
87	NC_010374	CAT	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825401
88	NC_010374	CCAA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	0 %	50 %	169825401
89	NC_010374	CAG	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825401
90	NC_010374	TCAAA	2	10	5364	5373	60 %	20 %	0 %	20 %	169825401
91	NC_010374	AGA	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
92	NC_010374	GAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
93	NC_010374	TGA	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825401
94	NC_010374	GAG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825401
95	NC_010374	TGA	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825402
96	NC_010374	CTG	2	6	5859	5864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825402
97	NC_010374	TCG	2	6	5887	5892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825402
98	NC_010374	TC	3	6	5894	5899	0 %	50 %	0 %	50 %	169825402
99	NC_010374	GCC	2	6	5939	5944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825402
100	NC_010374	TC	3	6	6016	6021	0 %	50 %	0 %	50 %	169825402
101	NC_010374	G	6	6	6029	6034	0 %	0 %	100 %	0 %	169825402
102	NC_010374	TGG	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825403
103	NC_010374	CCT	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825403
104	NC_010374	CTC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825403
105	NC_010374	TCGA	2	8	6674	6681	25 %	25 %	25 %	25 %	169825403
106	NC_010374	CGG	2	6	6749	6754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825404
107	NC_010374	GCC	2	6	6800	6805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825404
108	NC_010374	CGC	2	6	6939	6944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825404
109	NC_010374	GCG	2	6	6970	6975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825404
110	NC_010374	AGT	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825404
111	NC_010374	GCG	2	6	7188	7193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
112	NC_010374	AAGTGG	2	12	7289	7300	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	169825405
113	NC_010374	GGC	2	6	7345	7350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
114	NC_010374	GGC	2	6	7390	7395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
115	NC_010374	GCA	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825405
116	NC_010374	CCG	2	6	7458	7463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
117	NC_010374	CGT	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825405
118	NC_010374	GCC	2	6	7547	7552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
119	NC_010374	CGGC	2	8	7569	7576	0 %	0 %	50 %	50 %	169825405
120	NC_010374	GCC	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
121	NC_010374	GCC	2	6	7600	7605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
122	NC_010374	TGC	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825405
123	NC_010374	GGC	2	6	7704	7709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
124	NC_010374	GCA	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825405
125	NC_010374	ACC	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825405
126	NC_010374	CCG	2	6	7770	7775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
127	NC_010374	GCC	2	6	7800	7805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
128	NC_010374	CCT	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825405
129	NC_010374	GAG	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825405
130	NC_010374	GAA	2	6	7864	7869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825405
131	NC_010374	ATGCCT	2	12	7872	7883	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169825405
132	NC_010374	GGC	2	6	7917	7922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
133	NC_010374	GC	4	8	7957	7964	0 %	0 %	50 %	50 %	169825405
134	NC_010374	GGA	2	6	8002	8007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825405
135	NC_010374	CCT	2	6	8017	8022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825405
136	NC_010374	GC	4	8	8027	8034	0 %	0 %	50 %	50 %	169825405
137	NC_010374	GTCG	2	8	8072	8079	0 %	25 %	50 %	25 %	169825405
138	NC_010374	ACCTCG	2	12	8097	8108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169825405
139	NC_010374	ACAGCC	2	12	8163	8174	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	169825405
140	NC_010374	GCCGGA	2	12	8209	8220	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	169825405
141	NC_010374	GACC	2	8	8281	8288	25 %	0 %	25 %	50 %	169825405
142	NC_010374	TCA	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825405
143	NC_010374	GCT	2	6	8395	8400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825405
144	NC_010374	CGC	2	6	8439	8444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
145	NC_010374	GCACA	2	10	8474	8483	40 %	0 %	20 %	40 %	169825405
146	NC_010374	GGC	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
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149	NC_010374	GCCG	2	8	8707	8714	0 %	0 %	50 %	50 %	169825405
150	NC_010374	GCG	2	6	8719	8724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
151	NC_010374	CGC	2	6	8875	8880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
152	NC_010374	TGAG	2	8	8937	8944	25 %	25 %	50 %	0 %	169825405
153	NC_010374	CAA	2	6	8965	8970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825405
154	NC_010374	GAT	2	6	8995	9000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825405
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156	NC_010374	CGG	2	6	9089	9094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825405
157	NC_010374	TGG	2	6	9327	9332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825406
158	NC_010374	GC	3	6	9353	9358	0 %	0 %	50 %	50 %	169825406
159	NC_010374	CCT	2	6	9391	9396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825406
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161	NC_010374	GTCG	2	8	9709	9716	0 %	25 %	50 %	25 %	169825406
162	NC_010374	CGG	2	6	9729	9734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825406
163	NC_010374	CGG	2	6	9758	9763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825406
164	NC_010374	ACG	2	6	9774	9779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825406
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169	NC_010374	CGCT	2	8	9878	9885	0 %	25 %	25 %	50 %	169825406
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172	NC_010374	CGGC	2	8	9973	9980	0 %	0 %	50 %	50 %	169825406
173	NC_010374	GAG	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825406
174	NC_010374	GCG	2	6	10028	10033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825406
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252	NC_010374	AAT	2	6	14794	14799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825409
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254	NC_010374	AGCGT	2	10	15020	15029	20 %	20 %	40 %	20 %	169825409
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256	NC_010374	GA	3	6	15304	15309	50 %	0 %	50 %	0 %	169825409
257	NC_010374	GC	3	6	15329	15334	0 %	0 %	50 %	50 %	169825409
258	NC_010374	TC	3	6	15349	15354	0 %	50 %	0 %	50 %	169825409
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261	NC_010374	TC	3	6	15757	15762	0 %	50 %	0 %	50 %	169825409
262	NC_010374	TCT	2	6	15788	15793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825409
263	NC_010374	CA	3	6	15828	15833	50 %	0 %	0 %	50 %	169825409
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265	NC_010374	T	6	6	15910	15915	0 %	100 %	0 %	0 %	169825409
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287	NC_010374	TCTG	2	8	17569	17576	0 %	50 %	25 %	25 %	169825411
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.